A Standard Numbering Scheme for Class C β-Lactamases
Andrew Mack
(1, 2)
,
Melissa Barnes
(1, 2)
,
Magdalena Taracila
(1, 2)
,
Andrea Hujer
(1, 2)
,
Kristine Hujer
(1, 2)
,
Gabriel Cabot
(3, 4)
,
Michael Feldgarden
(5)
,
Daniel Haft
(5)
,
William Klimke
(5)
,
Focco van den Akker
(1)
,
Alejandro Vila
(6, 7, 8)
,
Andrea Smania
(9, 10)
,
Shozeb Haider
(11)
,
Krisztina Papp-Wallace
(1, 2)
,
Patricia Bradford
(12)
,
Gian Maria Rossolini
(13, 14)
,
Jean-Denis Docquier
(15)
,
Jean-Marie Frère
(16)
,
Moreno Galleni
(16)
,
Nancy Hanson
(17)
,
Antonio Oliver
(3, 18)
,
Patrick Plésiat
(19, 20, 21)
,
Laurent Poirel
(22)
,
Patrice Nordmann
(22)
,
Timothy Palzkill
(23)
,
George Jacoby
(24)
,
Karen Bush
(25)
,
Robert Bonomo
(1, 2)
1
Case Western Reserve University [Cleveland]
2 Louis Stokes Cleveland Veterans Affairs Medical Center
3 ISC - Instituto de Salud Carlos III [Madrid]
4 IdISBa - Fundació Institut d'Investigació Sanitària Illes Balears
5 NIH - National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
6 IBR - Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario [Rosario]
7 PLABEM - Plataforma de Biología Estructural y Metabolómica [Rosario]
8 Universidad Nacional de Rosario [Santa Fe]
9 CIQUIBIC - Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba
10 Universidad Nacional de Córdoba [Argentina]
11 UCL - University College of London [London]
12 Auteur indépendant
13 UniFI - Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
14 AOUC - Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi [Firenze] = Careggi University Hospital [Florence, Italy]
15 UNISI - Università degli Studi di Siena = University of Siena
16 CIP - Centre d’Ingénierie des Protéines [Université de Liège] = Centre for Protein Engineering [University of Liège]
17 Creighton University School of Medicine
18 Hospital Universitario Son Espases
19 Service de bactériologie [Besançon]
20 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
21 CNR - Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques
22 UNIFR - Université de Fribourg = University of Fribourg
23 BCM - Baylor College of Medicine
24 Lahey Hospital & Medical Center
25 Indiana University [Bloomington]
2 Louis Stokes Cleveland Veterans Affairs Medical Center
3 ISC - Instituto de Salud Carlos III [Madrid]
4 IdISBa - Fundació Institut d'Investigació Sanitària Illes Balears
5 NIH - National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
6 IBR - Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario [Rosario]
7 PLABEM - Plataforma de Biología Estructural y Metabolómica [Rosario]
8 Universidad Nacional de Rosario [Santa Fe]
9 CIQUIBIC - Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba
10 Universidad Nacional de Córdoba [Argentina]
11 UCL - University College of London [London]
12 Auteur indépendant
13 UniFI - Università degli Studi di Firenze = University of Florence = Université de Florence
14 AOUC - Azienda Ospedaliero Universitaria Careggi [Firenze] = Careggi University Hospital [Florence, Italy]
15 UNISI - Università degli Studi di Siena = University of Siena
16 CIP - Centre d’Ingénierie des Protéines [Université de Liège] = Centre for Protein Engineering [University of Liège]
17 Creighton University School of Medicine
18 Hospital Universitario Son Espases
19 Service de bactériologie [Besançon]
20 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
21 CNR - Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques
22 UNIFR - Université de Fribourg = University of Fribourg
23 BCM - Baylor College of Medicine
24 Lahey Hospital & Medical Center
25 Indiana University [Bloomington]
Andrew Mack
- Fonction : Auteur
- PersonId : 795337
- ORCID : 0000-0002-0131-7996
Gabriel Cabot
- Fonction : Auteur
- PersonId : 785895
- ORCID : 0000-0002-6452-9945
Krisztina Papp-Wallace
- Fonction : Auteur
- PersonId : 818475
- ORCID : 0000-0002-9976-7898
Patricia Bradford
- Fonction : Auteur
- PersonId : 818476
- ORCID : 0000-0002-1285-2978
Jean-Denis Docquier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1148523
- ORCID : 0000-0001-9483-4476
- IdRef : 234186305
Antonio Oliver
- Fonction : Auteur
- PersonId : 763700
- ORCID : 0000-0001-9327-1894
Patrick Plésiat
- Fonction : Auteur
- PersonId : 760623
- ORCID : 0000-0001-7381-5671
- IdRef : 05653664X
Timothy Palzkill
- Fonction : Auteur
- PersonId : 818477
- ORCID : 0000-0002-5267-0001
Karen Bush
- Fonction : Auteur
- PersonId : 806533
- ORCID : 0000-0002-7843-2474
- IdRef : 15815634X
Résumé
Unlike for classes A and B, a standardized amino acid numbering scheme has not been proposed for the class C (AmpC) β-lactamases, which complicates communication in the field. Here, we propose a scheme developed through a collaborative approach that considers both sequence and structure, preserves traditional numbering of catalytically important residues (Ser 64 , Lys 67 , Tyr 150 , and Lys 315 ), is adaptable to new variants or enzymes yet to be discovered and includes a variation for genetic and epidemiological applications.